4.5 细菌的遗传分析和基因定位

54
4.5 细细细细 细细细细细细细 细细细细细 细细细细细细细 细细细细 细细细细细细细 细细细细细细细 细细细 细细细 细细细细细细细细 :,,体,, 细细细细细细细 细细细细细20 细细 细细细细细细细细细 细细细细细细细 ( 细细细细细 ) 细细细细细细细 细细细细细 细细细 细细细细细

Upload: pink

Post on 27-Jan-2016

91 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

4.5 细菌的遗传分析和基因定位. 细菌作为遗传研究对象的特点 结构简单:属于原核生物,无明显细胞核,染色体裸露,不与组蛋白结合,不进行减数分裂。 世代周期短: 20 分钟一代 容易获得各种突变型 ① 合成代谢 缺陷型 ( 营养缺陷型 ) ② 分解代谢 缺陷型 ③ 抗性突变型 易培养,可长期保藏. 细菌之间遗传物质的转移方式. 转化 :细胞从周围介质中吸收裸露的 DNA 。 接合 : DNA 从供体菌到受体菌直接转移。 转导 :由噬菌体所介导的 DNA 从供体菌到受体菌的 转移。. 4.5.1 细菌的转化和基因定位. 转化的类型 - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

4.5 细菌的遗传分析和基因定位细菌作为遗传研究对象的特点 结构简单:属于原核生物,无明显细胞核,染色

体裸露,不与组蛋白结合,不进行减数分裂。 世代周期短: 20 分钟一代 容易获得各种突变型 ① 合成代谢缺陷型 ( 营养缺陷型 ) ② 分解代谢缺陷型 ③ 抗性突变型 易培养,可长期保藏

Page 2: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

细菌之间遗传物质的转移方式

转化:细胞从周围介质中吸收裸露的 DNA 。 接合: DNA 从供体菌到受体菌直接转移。 转导:由噬菌体所介导的 DNA 从供体菌到受体菌

的 转移。

Page 3: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

4.5.1 细菌的转化和基因定位 转化的类型 ① 自然转化( natural transformation ) 细菌能够自然地吸收 DNA ,如枯草杆菌的转化。 ② 工程转化( engineered transformation ) 通过某种处理使细菌能够摄入外源 DNA ,如大肠杆菌

的转化。 转化效率:约 1 % 转化片段的长度: 20kb

Page 4: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

细菌转化过程示意

Page 5: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

转化在基因定位中的应用 判断两个基因的位置关系① 观察 DNA 浓度降低时 AB 基因共转化频率的下降和 A 、

B 各自转化频率下降的程度: 程度相同表明 ;共转化频率下降的程度远大于各自转

化频率下降的程度,表明 。② 观察转化频率: AB 共转化频率与 A 、 B 各自转化的频率相近,表明 ;

相差很远,表明 。 基因作图:判断基因间的距离

连锁不连锁

连锁不连锁

Page 6: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

计算重组值

Page 7: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

遗传作图

Page 8: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

4.5.2 细菌的接合与基因定位

一、接合现象的发现1946 年,莱德伯格 (Lederberg) 和塔特姆 (Tatum)

A 菌株: met - bio - thi + leu + thr +( thi :硫胺素B1 )

B 菌株: met + bio + thi - leu - thr -

原养型: met + bio + thi + leu + thr +

Page 9: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

A 菌株: met - bio - thi + leu + thr +( thi :硫胺素 B1 ) B 菌株: met + bio + thi - leu - thr -

A A+B B

基本培养基 原养型: met + bio + thi + leu + thr +

出现频率: 10 - 7

Page 10: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

分析原因 发生了回复突变? 可能是转化的结果。 培养基中含有某些代谢产物,混合后这些产物

互相补充了对方的不足而得以在基本培养基上生长。

Page 11: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

结论:重组子的产生需要两个菌株的直接接触,二者之间发生了遗传物质的转移。

Davis(1950)U 型管实验

Page 12: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

结论:接合过程是一种单向转移,从供体到受体。

二、遗传物质的转移方向1953年,海斯 (W. Hayes) 的杂交实验

① 菌株 B ( str 处理)+ 菌株 A ↓

无菌落

② 菌株 A ( str 处理)+ 菌株B

↓ 有菌落

Page 13: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

三、 F因子1. F 因子:致育因子(性因子) 携带 F因子的菌株称为供体菌或雄性,用 F +表示。 未携带 F因子的菌株为受体菌或雌性,用 F -表示。2. F 因子的组成: ① 复制区 ( 含 2 个复制起点 oriT,oriV) ; ②致育基因区; ③配对区(含有 4 个 IS)

Page 14: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

3. F 因子的转移:

Page 15: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

4. F+×F- 的特点:(1) F因子转移的频率高, 1/10 ,使 F-→F+。 (2) 染色体重组频率低; 10-6 。 (3) F+×F+不发生接合。 因此, F+品系又称为低频重组品系 (low frequency re

combination , Lfr) 。

Page 16: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

四、高频重组 (Hfr)1.Hfr 的形成及转移过程 由 F因子和细菌染色体的单交换产生; 转移时带有供体细菌的染色体。

Page 17: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

2.Hfr 的特点 : (1) 染色体重组频率高,比 F+×F- 高 1000倍;(2)F因子转移频率低, F-→F+ 很少或没有。

3.Hfr 和 F+ 的联系和区别 联系: 都是雄性菌,含有 F质粒 区别:( 1 )前者高频重组,后者低频重组; ( 2 )前者 F因子转移频率低,后者 F因子转移频率高; ( 3)前者 F因子整合,后者 F因子游离。

Page 18: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

五、中断杂交作图 根据供体基因进入受体细胞的顺序和时间绘制连

锁图的 技术。

Page 19: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

1961 年 Jacob 和 Wollman 供体 HfrH : strs thr + leu +azir tonr lac + gal +

受体 F - : strr thr - leu - azis tons lac - gal -

操作方法: 37℃混合培养 每隔一段时间取样 搅拌器中断杂交 涂布含链霉素的基本筛选培养基 影印培养于含链霉素的几种不同的培养基(选择培养基)上 观察重组子 鉴定各基因的转移时间

Page 20: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 21: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 22: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

HfrH菌株各非选择标记基因进入 F -细菌的时间和频率

Page 23: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

 以基因出现的时间为标准,作出 E. coli 的遗传连锁图

Page 24: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

六、环状连锁图

结论:不同 Hfr 菌株向 F -细胞转移的顺序、起点和方向不同。表明大肠杆菌的染色体是环状的。

Page 25: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 26: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 27: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 28: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

七、细菌的重组作图 细菌重组的特点:① 基因重组发生在部分二倍体中;② 只有偶数次交换才能产生平衡的重组子;③ 在选择培养基上只出现一种重组子,而没有

相反的重组子。

Page 29: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 30: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

例如:根据中断杂交试验已知 lac 和 ade 基因是紧密连锁的,而且 lac 比 ade 先进入受体。

Hfr lac+ade+strs × F- lae-ade-strr

Page 31: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 32: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 33: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

未重组的基因型是 lac+ade+ 重组体的基因型是 lac-ade+

lac-ade 间的距离: lac-ade+

(lac+ade+)+(lac-ade+) ×100

lac-ade+ ade+= ×100

Page 34: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

八、 F’因子与性导

F’因子:从 Hfr 染色体上不精确分离产生的含有细菌基因组的 新的 F因子。性导:利用 F’因子将供体细胞的基因导入受体形成部分二倍体 的过程。内基因子和外基因子

Page 35: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

4.5.3 细菌的转导与作图

一、噬菌体噬菌体结构组成: 头部:核酸和蛋白质外壳; 颈部:中空的针状结构及

外鞘; 尾部:由基板、尾针和尾丝组成。

Page 36: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

类型: ①烈性噬菌体:使宿主发生裂解的噬菌体。 ②温和噬菌体:除偶尔情况外,感染后不裂解细菌的噬菌

体。 温和噬菌体的增殖周期: ①溶菌周期:细菌受到感染后,噬菌体迅速增殖,菌体被

裂解,噬菌体释放。 ②溶源周期:噬菌体感染细菌后,其 DNA整合到细菌染色

体中,随宿主染色体的复制而复制,细菌继续增殖。

Page 37: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 38: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位
Page 39: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

原噬菌体:整合到宿主染色体中的噬菌体基因组。 溶源性细菌:带有原噬菌体的细菌。 附加体:噬菌体既可整合在细菌染色体上,又可游离于细胞质中。

Page 40: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

Lederberg  和 N. Zinder 的杂交试验 (1952 年 ) 沙门氏菌  LT22: phe- trp- tyr- met+ his+ × LT2: phe+ trp+ tyr+ met- his-

        

二、细菌染色体的转导作图

结果 :10-5 频率出现野生型菌株

基本培养基

结论:重组通过一种过滤性因子实现。 后来发现这种过滤因子是一种温和噬菌体 P22 。

Page 41: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

转导类型:①普遍性转导:通过噬菌体可以转移细菌染色体上

的任何基因,如 P22 , P1 。

② 特异性转导:噬菌体只能转移细菌染色体的特定部分,如噬菌体。

Page 42: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

1.普遍性转导的过程

Page 43: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

2.普遍性转导作图① 原理: 如果两个基因始终一起转导或同时转导频率较高,那么表明这两个基因是连锁的;

两个基因同时转导的现象称为共转导或并发转导( contransduction );

两基因共转导频率愈高,表明两个基因连锁愈紧密;相反,共转导频率愈低,则表明两个基因距离愈远。

Page 44: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

判断细菌基因间的位置关系 以普遍性转导噬菌体 P1 为例,测定大肠杆菌的 leu 、 thr 、

azi三个基因的顺序。 供体 thr+ leu+ azir → 受体 thr- leu- azis ,观察其共转导率。

三个基因间的排列顺序

Page 45: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

② 重组值的计算 a+b+供体 → ab 受体

Page 46: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

3. 特异性转导 (局限性转导 )(1) 产生机制

Page 47: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

(2) 低频转导 (low-frequency transduction, LFT) 由于不正常环化现象发生的频率较低,在释放出的 106个噬

菌体中只有 1 个 gal +转导噬菌体感染受体,因此转导的频率很低,称为低频转导。

λdgal→ gal -受体

①稳定转导子

② 不稳定:整合—切离

Page 48: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

(3)高频转导 (high frequency trasduction , HFT)

由于产生 λ/λdgal双重溶源菌,使溶菌物中既含有大量的 λdgal ,又包含正常的 λ 噬菌体,正常的 λ起了辅助缺陷型噬菌体成熟的作用,所以称为辅助噬菌体,从而导致高频转导。

Page 49: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

4.6 噬菌体的重组作图一、常用的表型特征①宿主范围 (host range) 野生型 h + :能感染 E.coliB,不能感染 E.coli B/2,噬菌斑半透明; 突变型 h:二者均可感染,噬菌斑透明。②嗜菌斑形态 (plaque morphology) 野生型 r + :形成小菌斑 (1mm左右 ) ,边缘模糊; 突变型 r :形成大菌斑 (2mm左右 ) ,边缘清晰。③温度敏感

Page 50: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

用 h + r 和 hr +共感染 E.coliB

噬菌体染色体在宿主细胞内复制

噬菌体染色体间发生重组

噬菌体组装、细菌裂解、子噬菌体释放

噬菌体遗传重组原理示意

二、噬菌体的遗传重组与作图

接种在 E.coliB/B2混合培养物上

Page 51: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

h+r++h r重组值=

总噬菌斑数× 100%

Page 52: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

三基因之间的距离

Page 53: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

可能的排列顺序

再作杂交: rbrc+ × rc+rb

结果表明: rc-rb 的重组值 >rb-h所以 h位于 rb及 rc 之间,排列顺序为 rb-h-rcT2 噬菌体的连锁图是 环状的,所以 2 , 3 排列都对。

Page 54: 4.5  细菌的遗传分析和基因定位

噬菌体的遗传图与 DNA

遗传图: 环形 DNA :线性末端冗余:染色体双链 DNA 分子的两端带

有相同的碱基。头部满装机制