实验十 大肠杆菌( e.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)
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实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一). 一、目的 : 熟悉细菌接合和基因定位分析的原理; 掌握大肠杆菌非中断杂交分析的技术; 理解、区分中断杂交和非中断杂交分析的关键技术点。. 二、内容 : 母液配制,培养基培制,器具干热、湿热灭菌。 活化菌种,接种,扩菌,杂交,涂平板,培养,点种 A ,点种 B-G 。 实验结果观察统计分析,基因位点距离计算。. 配对区. 致育基因区. 大肠杆菌菌株: 1 ) F - 菌株 2 ) F + 菌株 - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
实验十 大肠杆菌(实验十 大肠杆菌( E.coilE.coil )梯度转)梯度转移基因定位(非中断杂交)移基因定位(非中断杂交)(一)(一)一、目的一、目的:
熟悉细菌接合和基因定位分析的原理; 掌握大肠杆菌非中断杂交分析的技术; 理解、区分中断杂交和非中断杂交分析的关键技术点。
二、内容二、内容: 母液配制,培养基培制,器具干热、湿热灭菌。 活化菌种,接种,扩菌,杂交,涂平板,培养,点种 A ,点种 B-G 。 实验结果观察统计分析,基因位点距离计算。
二、实验原理二、实验原理: F 因子:
DNA 小环,占染色体 DNA 的 2% 。
大肠杆菌菌株:1 ) F - 菌株2 ) F + 菌株3 )高频重组菌株( Hfr )
“ 雄性”“ 雌性”
原点
致育基因区配对区
复制区
Hfr 菌株 ×F- 菌株:Hfr 染色体从原点断裂,染色体向 Fˉ 菌株起始转移。 杂交时间: 全部染色体进入 Fˉ 需要 100min 。
F- 菌株 × F+ 菌株F+ 菌株
F- 菌株 × Hfr 菌株F- 不同类型的重组子菌株
杂交:
随机中断:各种条件影响→转移随机中断。完整染色体进入 Fˉ 细菌的机会很少,完整的 F 因子转移机会也很低。导致:
1 ) Hfr 菌株与 F- 菌株的杂交一般不会使 Fˉ 变成 Hfr 或 F+ 。2 ) Hfr 染色体上的基因呈梯度转移 : a
b a
c b a
d c b a
非中断杂交( interrupted matting )基因定位:自然中断重组的百分率为指标
中断杂交( non-interrupted matting )基因定位:人为中断接合供体基因在受体中的出现时间为指标
后者比前者操作复杂两种方法测定两个紧密连锁基因时精度较差(以传统重组作图更好)。
杂交基因定位
三、实验材料三、实验材料:Hfr 品系: CSH60 Strs ,其余性状为野生型(供体) F- 品系: CSH57 Strr ,多重生化缺陷型: ( met 、 lue 、
trp 、 his 、 ade or pur 、 arg 、 lac 、 gal ) (受体)
Fˉ 接受 Hfr 不同长度染色体→重组→各种重组子杂交
CSH57 Strr ,多重生化缺陷型不能合成 met 、 lue 、 trp 、 his 、 ade or pur 、 arg
不能利用 lac 、 gal
FF-- 品系(受体) :品系(受体) :
如何选出各种重组子,排除供(父)、受(本)体?选择性标记 (selected marker) 基因:目的:选择出全部的重组子,排除杂交中的受体菌。
措施:培养基中不加 Met 和 Leu 。选什么样的基因?
反选择性标记 (nonselected marker) 基因:目的:排除供体菌,同时保证全部的重组子存活。选什么样的基因?措施:在培养基中添加链霉素 (Str) 。
Met 和离 Leu 离原点最近
Str 离原点最远,使 Hfr 染色体更多机会进入受体
本实验所配制的选择培养基:A 培养基:排除供、受体选择全部重组子B~G 培养基:选择各种重组子求出重组频率确定基因连锁情况
各种选择性培养基各种选择性培养基添加物质 碳源
10×A
琼脂粉水
MgSO4
硫胺素 ( 盐酸噻胺, VB1)
精氨酸腺嘌呤色氨酸组氨酸
链霉素
A B C D E F G ←-- -- 葡萄糖 --------------→ 乳糖 半乳糖
+ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + + +
+ + + + + ++ + + + + ++ + + + + ++ + + + + +
+ + + + + + +
四、方法步骤四、方法步骤:重组子数目取决于接合细胞数,通常 Hfr 与 Fˉ 细胞数之比为 1:10~20 。重组子的检出:影印法,单菌落点种法 本次实验——单菌落点种法。
供体 CSH60
1 环菌接种
37°C 10~12h
受体 CSH57
LB
LB
1 环菌
1ml
1ml
37 °C 2~3h
扩菌
LB
LB
0.2 ml
4 ml
接合37 °C 振荡 100‘
A 对照
A 对照
A
A
A
A
A
A
0.1ml
0.1ml
涂A板
点50个单菌落
点50个单菌落
37 °C 24~48h
点A板
37 °C 24~48h B
C
D
E
F
G
点B-G
板37 °C
24~ 48h
观察结果
3个 200μL
3个 100μL
配制 各种选择性培养基的基本溶液
第一部分工作:为杂交做准备——配制各类母液、第一部分工作:为杂交做准备——配制各类母液、培养基,包装,灭菌培养基,包装,灭菌
LB 液体培养基各种选择性培养基的配制
包装各种器皿、用具
(一)配制各种选择性培养基的基本溶液 试剂名称 10 ×A 葡萄糖
乳糖半乳糖
MgSO4.7H2O
硫胺素精氨酸色氨酸组氨酸腺嘌呤
溶液规格 (119页) 20%
20%
20%
0.25M
1mg/1ml
10mg/ml
10mg/ml
10mg/ml
10mg/ml
配制量 500ml
200ml
25ml
25ml
25ml
25ml
25ml
25ml
25ml
25ml
注注:: 1)1) 色氨酸色氨酸 (Trp)(Trp) 需在需在50-60℃50-60℃ 水浴条件下溶解。水浴条件下溶解。 2)2) 腺嘌呤(腺嘌呤( AdeAde ))不溶于水 , 需先用不溶于水 , 需先用 1N1N( 不 要过浓过稀)( 不 要过浓过稀) HClHCl调成糊,逐滴加调成糊,逐滴加 1N1NHClHCl直到溶,再补水定容。直到溶,再补水定容。 3)3) 链霉素链霉素 (Str)(Str) 受热受热易分解,所以不能加入培易分解,所以不能加入培养基中一起灭菌,而应在养基中一起灭菌,而应在倒平板前,用无菌水现配倒平板前,用无菌水现配现用。现用。
(二)配制 LB 液体培养基:150ml ,分装: 2瓶 / 组, 5ml / 瓶,
其余交给老师(三)每组包装灭菌:
培养皿 20 个蓝、黄 tip头各 1盒,
接合用的空三角瓶( 100ml ) 1 个 牙签 200支( 20支左右一包)
用 50ml 小三角瓶分装更正更正:教材 p118“LB液”配制中,蒸馏水应为1000 mL
(五)配制(五)配制各种选择性培养基各种选择性培养基(此为(此为 100mL100mL 培养基配方)培养基配方)添加物质 碳源
10×A
琼脂粉水
MgSO4
硫胺素精氨酸腺嘌呤色氨酸组氨酸
链霉素
2ml
10ml
2g
88ml
0.4ml
0.4ml
0.4ml
0.4ml
0.4ml
0.4ml
0.4ml
A B C D E F G ←-- -- 葡萄糖 --------------→ 乳糖 半乳糖
+ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + + ++ + + + + ++ + + + + ++ + + + + ++ + + + + +
+ + + + + + +
(每组需 250ml ) (每组各需 30ml)
配制方法配制方法:1. 称取琼脂 + 水 , 煮沸2. 另取其它各成分于一小烧杯中,一同加入煮好的琼脂中。3. 分装 , 灭菌( 8磅, 112℃, 20min )
各小组灭菌后需收齐的物品各小组灭菌后需收齐的物品:
A 培养基 250 mL (分装 2 个 250ml 三角瓶)B-G 培养基 各 30mL (装于 6 个 100mL 三角瓶)LB 培养基 10mL (分装 2 个 50mL 三角瓶 , 上交)空的 100mL 三角瓶 ( 1 个)牙签( 200 只)枪头(蓝、黄各 1 盒,)培养皿( 20 个)
开始实验先请老师安排试剂配制分工。