实验十 大肠杆菌( e.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

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实实实 实实实实实实实 实实实实E.coil E.coil 实实实实实实实实 实实实实实实实实 实实实实实实 () 实实实实实实 () (一) (一) 实实 一、 实实 一、 : 实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实 实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实实 、。

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实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一). 一、目的 : 熟悉细菌接合和基因定位分析的原理; 掌握大肠杆菌非中断杂交分析的技术; 理解、区分中断杂交和非中断杂交分析的关键技术点。. 二、内容 : 母液配制,培养基培制,器具干热、湿热灭菌。 活化菌种,接种,扩菌,杂交,涂平板,培养,点种 A ,点种 B-G 。 实验结果观察统计分析,基因位点距离计算。. 配对区. 致育基因区. 大肠杆菌菌株: 1 ) F - 菌株 2 ) F + 菌株 - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

实验十 大肠杆菌(实验十 大肠杆菌( E.coilE.coil )梯度转)梯度转移基因定位(非中断杂交)移基因定位(非中断杂交)(一)(一)一、目的一、目的:

熟悉细菌接合和基因定位分析的原理; 掌握大肠杆菌非中断杂交分析的技术; 理解、区分中断杂交和非中断杂交分析的关键技术点。

Page 2: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

二、内容二、内容: 母液配制,培养基培制,器具干热、湿热灭菌。 活化菌种,接种,扩菌,杂交,涂平板,培养,点种 A ,点种 B-G 。 实验结果观察统计分析,基因位点距离计算。

Page 3: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

二、实验原理二、实验原理: F 因子:

DNA 小环,占染色体 DNA 的 2% 。

大肠杆菌菌株:1 ) F - 菌株2 ) F + 菌株3 )高频重组菌株( Hfr )

“ 雄性”“ 雌性”

原点

致育基因区配对区

复制区

Page 4: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

 

Hfr 菌株 ×F- 菌株:Hfr 染色体从原点断裂,染色体向 Fˉ 菌株起始转移。 杂交时间: 全部染色体进入 Fˉ 需要 100min 。

Page 5: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

F- 菌株 × F+ 菌株F+ 菌株

F- 菌株 × Hfr 菌株F- 不同类型的重组子菌株

杂交:

Page 6: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

随机中断:各种条件影响→转移随机中断。完整染色体进入 Fˉ 细菌的机会很少,完整的 F 因子转移机会也很低。导致:

1 ) Hfr 菌株与 F- 菌株的杂交一般不会使 Fˉ 变成 Hfr 或 F+ 。2 ) Hfr 染色体上的基因呈梯度转移 : a

b a

c b a

d c b a

Page 7: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

非中断杂交( interrupted matting )基因定位:自然中断重组的百分率为指标

中断杂交( non-interrupted matting )基因定位:人为中断接合供体基因在受体中的出现时间为指标

后者比前者操作复杂两种方法测定两个紧密连锁基因时精度较差(以传统重组作图更好)。

杂交基因定位

Page 8: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

三、实验材料三、实验材料:Hfr 品系: CSH60 Strs ,其余性状为野生型(供体) F- 品系: CSH57 Strr ,多重生化缺陷型: ( met 、 lue 、

trp 、 his 、 ade or pur 、 arg 、 lac 、 gal ) (受体)

Fˉ 接受 Hfr 不同长度染色体→重组→各种重组子杂交

Page 9: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

CSH57 Strr ,多重生化缺陷型不能合成 met 、 lue 、 trp 、 his 、 ade or pur 、 arg

不能利用 lac 、 gal

FF-- 品系(受体) :品系(受体) :

Page 10: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

如何选出各种重组子,排除供(父)、受(本)体?选择性标记 (selected marker) 基因:目的:选择出全部的重组子,排除杂交中的受体菌。

措施:培养基中不加 Met 和 Leu 。选什么样的基因?

反选择性标记 (nonselected marker) 基因:目的:排除供体菌,同时保证全部的重组子存活。选什么样的基因?措施:在培养基中添加链霉素 (Str) 。

Met 和离 Leu 离原点最近

Str 离原点最远,使 Hfr 染色体更多机会进入受体

Page 11: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

本实验所配制的选择培养基:A 培养基:排除供、受体选择全部重组子B~G 培养基:选择各种重组子求出重组频率确定基因连锁情况

Page 12: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

各种选择性培养基各种选择性培养基添加物质 碳源

10×A

琼脂粉水

MgSO4

硫胺素 ( 盐酸噻胺, VB1)

精氨酸腺嘌呤色氨酸组氨酸

链霉素

A   B   C D E   F G ←--   -- 葡萄糖   --------------→ 乳糖 半乳糖

+  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  +

+     +  +  +  +  ++  +     +  +  +  ++  +  +     +  +  ++  +  +  +     +  +

+  +  +  +  +  +  +

Page 13: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

四、方法步骤四、方法步骤:重组子数目取决于接合细胞数,通常 Hfr 与 Fˉ 细胞数之比为 1:10~20 。重组子的检出:影印法,单菌落点种法 本次实验——单菌落点种法。

Page 14: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

供体 CSH60

1 环菌接种

37°C 10~12h

受体 CSH57

LB

LB

1 环菌

1ml

1ml

37 °C 2~3h

扩菌

LB

LB

0.2 ml

4 ml

接合37 °C 振荡 100‘

A 对照

A 对照

A

A

A

A

A

A

0.1ml

0.1ml

涂A板

点50个单菌落

点50个单菌落

37 °C 24~48h

点A板

37 °C 24~48h B

C

D

E

F

G

点B-G

板37 °C

24~ 48h

观察结果

3个 200μL

3个 100μL

Page 15: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)
Page 16: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

配制 各种选择性培养基的基本溶液

第一部分工作:为杂交做准备——配制各类母液、第一部分工作:为杂交做准备——配制各类母液、培养基,包装,灭菌培养基,包装,灭菌

LB 液体培养基各种选择性培养基的配制

包装各种器皿、用具

Page 17: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

(一)配制各种选择性培养基的基本溶液 试剂名称 10 ×A 葡萄糖

乳糖半乳糖

MgSO4.7H2O

硫胺素精氨酸色氨酸组氨酸腺嘌呤

溶液规格 (119页) 20%

20%

20%

0.25M

1mg/1ml

10mg/ml

10mg/ml

10mg/ml

10mg/ml

配制量 500ml

200ml

25ml

25ml

25ml

25ml

25ml

25ml

25ml

25ml

注注:: 1)1) 色氨酸色氨酸 (Trp)(Trp) 需在需在50-60℃50-60℃ 水浴条件下溶解。水浴条件下溶解。 2)2) 腺嘌呤(腺嘌呤( AdeAde ))不溶于水 , 需先用不溶于水 , 需先用 1N1N( 不 要过浓过稀)( 不 要过浓过稀) HClHCl调成糊,逐滴加调成糊,逐滴加 1N1NHClHCl直到溶,再补水定容。直到溶,再补水定容。 3)3) 链霉素链霉素 (Str)(Str) 受热受热易分解,所以不能加入培易分解,所以不能加入培养基中一起灭菌,而应在养基中一起灭菌,而应在倒平板前,用无菌水现配倒平板前,用无菌水现配现用。现用。

Page 18: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

(二)配制 LB 液体培养基:150ml ,分装: 2瓶 / 组, 5ml / 瓶,

其余交给老师(三)每组包装灭菌:

培养皿 20 个蓝、黄 tip头各 1盒,

接合用的空三角瓶( 100ml ) 1 个 牙签 200支( 20支左右一包)

用 50ml 小三角瓶分装更正更正:教材 p118“LB液”配制中,蒸馏水应为1000 mL

Page 19: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

(五)配制(五)配制各种选择性培养基各种选择性培养基(此为(此为 100mL100mL 培养基配方)培养基配方)添加物质 碳源

10×A

琼脂粉水

MgSO4

硫胺素精氨酸腺嘌呤色氨酸组氨酸

链霉素

2ml

10ml

2g

88ml

0.4ml

0.4ml

0.4ml

0.4ml

0.4ml

0.4ml

0.4ml

A   B   C D E   F G ←--   -- 葡萄糖   --------------→ 乳糖 半乳糖

+  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++  +  +  +  +  +  ++     +  +  +  +  ++  +     +  +  +  ++  +  +     +  +  ++  +  +  +     +  +

+  +  +  +  +  +  +

(每组需 250ml ) (每组各需 30ml)

Page 20: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

配制方法配制方法:1. 称取琼脂 + 水 , 煮沸2. 另取其它各成分于一小烧杯中,一同加入煮好的琼脂中。3. 分装 , 灭菌( 8磅, 112℃, 20min )

Page 21: 实验十 大肠杆菌( E.coil )梯度转移基因定位(非中断杂交) (一)

各小组灭菌后需收齐的物品各小组灭菌后需收齐的物品:

A 培养基 250 mL (分装 2 个 250ml 三角瓶)B-G 培养基 各 30mL (装于 6 个 100mL 三角瓶)LB 培养基 10mL (分装 2 个 50mL 三角瓶 , 上交)空的 100mL 三角瓶 ( 1 个)牙签( 200 只)枪头(蓝、黄各 1 盒,)培养皿( 20 个)

开始实验先请老师安排试剂配制分工。